O laboratório de Genética Molecular (LAGEM) concentra seus estudos na área de fitopatologia. Possui uma infra-estrutura de 347 m2 composta de salas, laboratórios, biblioteca, almoxarifado, com equipamentos diversos que permitem estudos sobre diferentes aspectos dos microrganismos causadores de doenças de plantas, com emprego de técnicas convencionais e moleculares. Mantém uma coleção de mais de 500 isolados ativos de fungos e bactérias, de diferentes culturas de importância agrícola. Também está engajado na formação de mão de obra qualificada, oferecendo estágio para alunos de engenharia agronômica, biologia e biotecnologia, com treinamento em pesquisa e diagnose de doenças de plantas.